Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT28Q7Z3Y7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms