Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY3Q7L099 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms