Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMUB2Q71RG4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms