Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP31Q70CQ4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
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