Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00299Q6ZSB3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00299Q6ZSB3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms