Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms