Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRSAM1Q6UWE0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms