Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms