Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CNNM4Q6P4Q7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNNM4Q6P4Q7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNNM4Q6P4Q7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNNM4Q6P4Q7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms