Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC41PQ6P2S7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms