Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUQ1

RINT1, RAD50-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RINT1Q6NUQ1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RINT1Q6NUQ1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RINT1Q6NUQ1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RINT1Q6NUQ1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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