Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF6Q6KF10 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms