Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 RTN1-203ENST00000395090 1609 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHIC1Q5VXU3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 AL591767.1-201ENST00000557160 568 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms