Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOCADQ5VW36 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FOCADQ5VW36 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms