Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF38BQ5VTL8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms