Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WDR78Q5VTH9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms