Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms