Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms