Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms