Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC92Q53HC0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms