Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYTL3Q4VX76 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms