Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TPRNQ4KMQ1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
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