Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ISXQ2M1V0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms