Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MICAQ29983 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MICAQ29983 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MICAQ29983 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MICAQ29983 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MICAQ29983 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MICAQ29983 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MICAQ29983 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MICAQ29983 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MICAQ29983 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MICAQ29983 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MICAQ29983 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MICAQ29983 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MICAQ29983 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MICAQ29983 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MICAQ29983 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MICAQ29983 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MICAQ29983 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MICAQ29983 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MICAQ29983 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MICAQ29983 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MICAQ29983 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MICAQ29983 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MICAQ29983 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MICAQ29983 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MICAQ29983 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MICAQ29983 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MICAQ29983 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MICAQ29983 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MICAQ29983 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MICAQ29983 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MICAQ29983 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MICAQ29983 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MICAQ29983 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MICAQ29983 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MICAQ29983 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MICAQ29983 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MICAQ29983 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MICAQ29983 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MICAQ29983 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MICAQ29983 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MICAQ29983 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MICAQ29983 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MICAQ29983 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MICAQ29983 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MICAQ29983 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MICAQ29983 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MICAQ29983 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MICAQ29983 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MICAQ29983 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MICAQ29983 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MICAQ29983 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MICAQ29983 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MICAQ29983 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MICAQ29983 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MICAQ29983 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MICAQ29983 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MICAQ29983 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MICAQ29983 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MICAQ29983 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MICAQ29983 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MICAQ29983 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MICAQ29983 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MICAQ29983 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MICAQ29983 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MICAQ29983 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MICAQ29983 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MICAQ29983 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MICAQ29983 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MICAQ29983 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MICAQ29983 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MICAQ29983 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MICAQ29983 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MICAQ29983 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MICAQ29983 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MICAQ29983 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MICAQ29983 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MICAQ29983 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MICAQ29983 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MICAQ29983 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MICAQ29983 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MICAQ29983 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MICAQ29983 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MICAQ29983 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MICAQ29983 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MICAQ29983 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MICAQ29983 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MICAQ29983 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MICAQ29983 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MICAQ29983 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MICAQ29983 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MICAQ29983 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MICAQ29983 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MICAQ29983 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MICAQ29983 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MICAQ29983 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MICAQ29983 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MICAQ29983 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MICAQ29983 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MICAQ29983 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms