Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMPQ1L6U9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms