Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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