Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CARTPTQ16568 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CARTPTQ16568 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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