Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms