Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC85BQ15834 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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