Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIP13Q15645 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms