Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN1Q15223 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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