Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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COL9A2Q14055 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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COL9A2Q14055 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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COL9A2Q14055 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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