Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Length 614 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA4Q13772 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA4Q13772 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA4Q13772 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NCOA4Q13772 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA4Q13772 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA4Q13772 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA4Q13772 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA4Q13772 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA4Q13772 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA4Q13772 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA4Q13772 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA4Q13772 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA4Q13772 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA4Q13772 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA4Q13772 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA4Q13772 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA4Q13772 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA4Q13772 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA4Q13772 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA4Q13772 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA4Q13772 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA4Q13772 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA4Q13772 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA4Q13772 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA4Q13772 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA4Q13772 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA4Q13772 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA4Q13772 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NCOA4Q13772 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA4Q13772 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA4Q13772 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA4Q13772 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCOA4Q13772 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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NCOA4Q13772 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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NCOA4Q13772 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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NCOA4Q13772 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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NCOA4Q13772 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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NCOA4Q13772 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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NCOA4Q13772 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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NCOA4Q13772 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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NCOA4Q13772 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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