Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
GPM6BQ13491 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPM6BQ13491 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms