Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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PTPRSQ13332 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
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PTPRSQ13332 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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PTPRSQ13332 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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PTPRSQ13332 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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PTPRSQ13332 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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PTPRSQ13332 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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PTPRSQ13332 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRSQ13332 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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PTPRSQ13332 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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PTPRSQ13332 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRSQ13332 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRSQ13332 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRSQ13332 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRSQ13332 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRSQ13332 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRSQ13332 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRSQ13332 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRSQ13332 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRSQ13332 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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