Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIGQ13278 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIGQ13278 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIGQ13278 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIGQ13278 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIGQ13278 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIGQ13278 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIGQ13278 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIGQ13278 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIGQ13278 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIGQ13278 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIGQ13278 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIGQ13278 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIGQ13278 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIGQ13278 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIGQ13278 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIGQ13278 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIGQ13278 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIGQ13278 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIGQ13278 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIGQ13278 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIGQ13278 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIGQ13278 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIGQ13278 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIGQ13278 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIGQ13278 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIGQ13278 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIGQ13278 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIGQ13278 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RIGQ13278 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RIGQ13278 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIGQ13278 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIGQ13278 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIGQ13278 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIGQ13278 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIGQ13278 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIGQ13278 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIGQ13278 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIGQ13278 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIGQ13278 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIGQ13278 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIGQ13278 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIGQ13278 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIGQ13278 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIGQ13278 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIGQ13278 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIGQ13278 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIGQ13278 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIGQ13278 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIGQ13278 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIGQ13278 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIGQ13278 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIGQ13278 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RIGQ13278 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RIGQ13278 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RIGQ13278 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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