Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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