Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKAA1Q13131 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKAA1Q13131 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms