Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRPL28Q13084 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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