Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANK3Q12955 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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