Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
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FOXC1Q12948 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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FOXC1Q12948 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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FOXC1Q12948 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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FOXC1Q12948 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
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FOXC1Q12948 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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FOXC1Q12948 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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FOXC1Q12948 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXC1Q12948 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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