Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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KCNH2Q12809 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
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KCNH2Q12809 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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KCNH2Q12809 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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KCNH2Q12809 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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KCNH2Q12809 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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