Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CPSF1Q10570 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
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