Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC15Q0P6D6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms