Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms