Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms