Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms