Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms