Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSME1Q06323 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms