Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC18A2Q05940 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A2Q05940 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms